ALT SPL MUT DB

Alternative Splicing Mutation Database

Bechtel J M, Rajesh P, Ilikchyan I, Deng Y, Mishra P K, Wang Q, Wu X, Afonin K, Grose W E, Wang Y, Khuder S, and Fedorov A
NOTE: This is the final 1.0 release of the ASMD. All substitution mutations now have a note describing the codon change involved, based on the exon phase according to the EID. Entry 11 was found to describe a substitution in the last position of its exon (so, in a splicing junction) and had to be removed. A deposition form will be forthcoming.
NOTE: Later releases of the ASMD are now available by following this link. It has a much improved interface, many more entries, a true relational database back-end, and a public deposition form. This site is preserved for now, but may disappear in the future. The link to the more permanent home for the 1.0 release is http://mco321125.meduohio.edu/~jbechtel/asmd/1.0/. Please update any bookmarks to reflect the new location.


Gene info: EID ID [3717_NT_022517]
>3717_NT_022517 protein_id:NP_000240.1; Homo sapiens chromosome 3 genomic contig. /gene="MLH1"; intron(phase:200202021202120000,size:2955,4245,3347,2516,1750,2914,148,2332,2961,2710,5173,2776,11253,1973,5187,833,294,1468,intr_sum:54835); exon(size:176,91,99,74,73,92,43,89,113,94,154,371,149,109,64,165,93,114,361,ex_sum:2524); {splice:gtag,gtag,gtag,gtag,gtag,gtag,gtag,gtag,gtag,gtag,gtag,gtag,gtag,gtag,gtag,gtag,gtag,gtag}; CDS_start=61, CDS_end=57166, CDS_len=2271
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